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Application de modèles dynamiques bayésiens à la prévision des efflorescences à Dinophysis à Antifer (Baie de Seine) ArchiMer
Soudant, Dominique.
L'objectif de ce travail était de mettre en place un outil mathématique permettant de prévoir les concentrations en Dinophysis cf. acuminata, micro-algue toxique. Nous avons décidé d'utiliser des méthodes dynamiques de prévision bayésienne : modèles polynomiaux du premier, second et troisième ordre, modèle polynomial du premier ordre avec intervention, et modèle de régression multilinéaire. Les modèles polynomiaux du premier, second et troisième ordre se sont avérés inadaptés. Le modèle de régression multilinéaire a été testé avec les variables concentrations en phosphate (PO4) et en nitrate (NO3). Ce modèle est insatisfaisant du fait de l'inconstance des relations entre la concentration en Dinophysis cf. acuminata et les régresseurs. Le modèle polynomial...
Tipo: Text Palavras-chave: Modèle dynamique bayésien; Prévision; Séries chronologiques; Dinophysis; Antifer.
Ano: 1993 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00430/54178/55519.pdf
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Application de modèles dynamiques bayésiens aux séries temporelles de Dinophysis à Antifer (Normandie, France) ArchiMer
Soudant, Dominique.
Le Dinophysis est une microalgue toxique à l’origine d’epidémies diarrhéiques. En dépit de nombreuses études, l’écologie et la biologie de ce genre phytoplanctonique restent mal connues. Afin de déterminer les conditions d’apparition de Dinophysis cf. acuminata sur le site d’Antifer (Normandie, France), des prélèvements d’eau de mer ont été effectués quasi-journellement pendant les périodes estivales des années 1987 à 1993. Les séries temporelles résultantes concernent la concentration de la microalgue et les facteurs chimiques, physiques et météorologiques. L’analyse de ces données à l’aide d’outils sta- tistiques classiques (e.g. régression) s’est avérée difficile (e.g. instabilité temporelle des résultats). Une caractéristique commune de ces méthodes...
Tipo: Text Palavras-chave: Modélisation; Statistique; Dynamique; Séries temporelles; Bayésien; Dinophysis; Baie de Seine.
Ano: 1997 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00015/12576/9446.pdf
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Assessing phytoplankton realized niches using a French National Phytoplankton Monitoring Network ArchiMer
Hernandez Farinas, Tania; Bacher, Cedric; Soudant, Dominique; Belin, Catherine; Barille, Laurent.
Relating environmental factors to species occurrence is a fundamental step in a better understanding of the community structure, the spatial and temporal dynamics of populations and how species may respond to environmental changes. In this paper, we used phytoplankton occurrence data, from a French national phytoplankton monitoring network, and environmental variables with the aim of characterizing the realized ecological niches of phytoplankton groups. We selected 35 phytoplankton taxa representing the most important taxa in terms of occurrence frequency and abundance along the French coast of the eastern English Channel, the Southern Bight of the North Sea and the Atlantic Ocean. We show that environmental variables such as nutrient concentration, water...
Tipo: Text Palavras-chave: Phytoplankton; Environment; Niche position; Tolerance; Kernel density; Outlying mean index.
Ano: 2015 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00255/36627/35263.pdf
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Bassin Adour-Garonne : hydrologie et phytoplancton – Résultats 2013-2018 ArchiMer
Auby, Isabelle; D'Amico, Florence; Meteigner, Claire; Rumebe, Myriam; Tournaire, Marie-pierre; Rigouin, Loic; Gouriou, Laure; Lissardy, Muriel; Sanchez, Florence; De Casamajor, Marie-noelle; Morandeau, Gilles; Ganthy, Florian; Trut, Gilles; Trut, Florence; Caill-milly, Nathalie; Oger-jeanneret, Helene; Guesdon, Stephane; Chabirand, Jean-michel; Morin, Dimitri; Piraud, Aude; Geairon, Philippe; Grizon, James; Seugnet, Jean-luc; Thomas, Gerard; Bruneau, Audrey; Soudant, Dominique; Gautier, Emeric; Michel, Valérie; Dupin, Michel.
Ce rapport rend compte des résultats sur les paramètres hydrologiques et le phytoplancton acquis dans le cadre de la DCE (contrôle de surveillance entre 2013 et 2018), dans les masses d’eau côtières et de transition du bassin Adour-Garonne
Tipo: Text Palavras-chave: Directive Cadre sur l’Eau; Hydrologie; Phytoplancton.
Ano: 2019 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00516/62735/67113.pdf
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Bassin Adour-Garonne : Hydrologie et phytoplancton - Résultats 2015-2019 ArchiMer
Auby, Isabelle; D'Amico, Florence; Meteigner, Claire; Rumebe, Myriam; Tournaire, Marie-pierre; Rigouin, Loic; Gouriou, Laure; Lissardy, Muriel; Sanchez, Florence; De Casamajor, Marie-noelle; Morandeau, Gilles; Ganthy, Florian; Trut, Gilles; Trut, Florence; Caill-milly, Nathalie; Antajan, Elvire; Guesdon, Stephane; Chabirand, Jean-michel; Morin, Dimitri; Genauzeau, Sylvie; Piraud, Aude; Geairon, Philippe; Grizon, James; Seugnet, Jean-luc; Thomas, Gerard; Bruneau, Audrey; Soudant, Dominique; Gautier, Emeric; Michel, Valérie; Dupin, Michel.
Ce rapport rend compte des résultats sur les paramètres hydrologiques et le phytoplancton acquis dans le cadre de la DCE (contrôle de surveillance entre 2014 et 2019), dans les masses d’eau côtières et de transition du bassin Adour-Garonne
Tipo: Text Palavras-chave: Directive Cadre sur l’Eau; Hydrologie; Phytoplancton.
Ano: 2020 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00653/76529/77618.pdf
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Bilan des différentes approches mises en œuvre lors de l’expertise sur les données bancarisées et propositions d’harmonisation ArchiMer
Guigues, Nathalie; Soudant, Dominique; Assoumani, Azziz; Ghestem, Jean-philippe.
L’amélioration continue de la qualité des données de la surveillance a pour objectif de rendre plus fiables et mieux documentées les données produites dans le cadre de la surveillance des milieux aquatiques. Ces données sont bancarisées dans des bases de données nationales (ADES pour les eaux souterraines, QUADRIGE pour le milieu marin, Naïades pour les eaux de surface) ou propres à chaque Agence ou Office de l’eau. Maîtriser la qualité de la donnée, notamment au travers des métadonnées associées, permet à la fois de faciliter leur exploitation dans le cadre d’expertises et/ou des évaluations de l’état des masses d’eau, mais aussi de mieux les comparer dans l’espace et le temps.   Depuis 2011, différentes études ont été conduites dans le cadre des...
Tipo: Text
Ano: 2020 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00648/75981/76873.pdf
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Comparison of microbiological contamination level between different species of shellfish ArchiMer
Amouroux, Isabelle; Soudant, Dominique.
The French microbiological monitoring network (REMI) has been carried out since 1989 in order to assess faecal contamination levels (Escherichia coli) of shellfish production areas. It has been shown that species growing at the same site may show differences in microbiological contamination. The aim of this study is to investigate these differences and to examine how it can be used in the context of monitoring networks, notably in identifying indicator species. We would expect an indicator species to yield results at least as high as those of the other species present. Of the 372 monitoring points defined in the REMI in 2011, 20 points are sampled at the same time for at least two different species of shellfish, usually on a monthly basis. This study was...
Tipo: Text
Ano: 2011 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00176/28731/27199.pdf
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Contribution of benthic microalgae to the temporal variation in phytoplankton assemblages in a macrotidal system ArchiMer
Hernandez Farinas, Tania; Ribeiro, Lourenco; Soudant, Dominique; Belin, Catherine; Bacher, Cedric; Lampert, Luis; Barille, Laurent.
Suspended marine benthic microalgae in the water column reflect the close relationship between the benthic and pelagic components of coastal ecosystems. In this study, a 12-year phytoplankton time-series was used to investigate the contribution of benthic microalgae to the pelagic system at a site along the French-Atlantic coast. Furthermore, all taxa identified were allocated into different growth forms in order to study their seasonal patterns. The highest contribution of benthic microalgae was observed during the winter period, reaching up to 60% of the carbon biomass in the water column. The haptobenthic growth form showed the highest contribution in terms of biomass, dominant in the fall-winter period when the turbidity and the river flow were high....
Tipo: Text Palavras-chave: Co-inertia; Dynamic linear models; Epipelon; Epiphyton; Haptobenthos; Microphytobenthos growth forms; Seasonality; Tychoplankton.
Ano: 2017 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00392/50345/51035.pdf
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Evaluation DCE avril 2009 : élément de qualité oxygène. Document général pour l'ensemble des masses d'eaux de la France métropolitaine - Convention 2009 - Action 4 ArchiMer
Daniel, Anne; Soudant, Dominique.
Le bilan d'oxygène figure parmi les éléments de qualités physico-chimiques retenus par la DCE pour la classification de l'état écologique des masses d'eaux littorales. Le présent document est un premier essai d'évaluation réalisées sur les masses d'eaux retenues au titre du contrôle de surveillance, à partir des données disponibles dans Quadrige² sur la période 2003-2008.
Tipo: Text
Ano: 2009 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00019/12992/9967.pdf
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Evaluation DCE avril 2009 : élément de qualité température. Document général pour l'ensemble des masses d'eaux de la France métropolitaine - Convention 2009 - Action 4 ArchiMer
Daniel, Anne; Soudant, Dominique.
La température figure parmi les éléments de qualité physico-chimique retenus par la DCE pour la classification de l'état écologique des masses d'eaux littorales. Le présent document est une première évaluation réalsiées sur les masses d'eaux retenues au titre du contrôle de surveillance, à partir des données disponibles dans Quadrige² sur la période 2003-2008.
Tipo: Text Palavras-chave: DCE; Température; Indicateur; Réseaux surveillance.
Ano: 2009 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00019/12993/9968.pdf
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Évaluation DCE décembre 2008 - Élément de qualité : phytoplancton ArchiMer
Soudant, Dominique; Belin, Catherine.
La Directive Cadre sur l’Eau (DCE 2000/60/CE) du 23 octobre 2000 définit un cadre pour la gestion et la protection des eaux par grand bassin hydrographique au plan européen. Elle fixe un objectif de bon état écologique et chimique pour les eaux superficielles. La Directive s’appuie sur l’évaluation d’un certain nombre d’éléments de qualité pour définir l’état global d’une masse d’eau. La liste des éléments de qualité à prendre en compte varie selon la catégorie d’eau superficielle. Le phytoplancton figure parmi les éléments de qualité biologiques retenus pour la classification de l'état écologique des masses d’eaux littorales, c’est à dire les eaux côtières et de transition. Il est évalué à partir de trois composantes : biomasse, abondance et composition...
Tipo: Text
Ano: 2009 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00015/12587/9462.pdf
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Évaluation DCE décembre 2008, Éléments d’expertise - Élément de qualité : phytoplancton, Agence de l’eau : Adour-Garonne ArchiMer
Soudant, Dominique; Belin, Catherine.
La Directive Cadre sur l’Eau (DCE 2000/60/CE) du 23 octobre 2000 définit un cadre pour la gestion et la protection des eaux par grand bassin hydrographique au plan européen. Elle fixe un objectif de bon état écologique et chimique pour les eaux superficielles. La Directive s’appuie sur l’évaluation d’un certain nombre d’éléments de qualité pour définir l’état global d’une masse d’eau. La liste des éléments de qualité à prendre en compte varie selon la catégorie d’eau superficielle. Le phytoplancton figure parmi les éléments de qualité biologiques retenus pour la classification de l'état écologique des masses d’eaux littorales, c’est à dire les eaux côtières et de transition. Il est évalué à partir de trois composantes : biomasse, abondance et composition...
Tipo: Text
Ano: 2009 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00014/12570/9469.pdf
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Évaluation DCE décembre 2008, Éléments d’expertise - Élément de qualité : phytoplancton, Agence de l’eau : Artois-Picardie ArchiMer
Soudant, Dominique; Belin, Catherine.
La Directive Cadre sur l’Eau (DCE 2000/60/CE) du 23 octobre 2000 définit un cadre pour la gestion et la protection des eaux par grand bassin hydrographique au plan européen. Elle fixe un objectif de bon état écologique et chimique pour les eaux superficielles. La Directive s’appuie sur l’évaluation d’un certain nombre d’éléments de qualité pour définir l’état global d’une masse d’eau. La liste des éléments de qualité à prendre en compte varie selon la catégorie d’eau superficielle. Le phytoplancton figure parmi les éléments de qualité biologiques retenus pour la classification de l'état écologique des masses d’eaux littorales, c’est à dire les eaux côtières et de transition. Il est évalué à partir de trois composantes : biomasse, abondance et composition...
Tipo: Text
Ano: 2009 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00015/12585/9459.pdf
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Évaluation DCE décembre 2008, Éléments d’expertise - Élément de qualité : phytoplancton, Agence de l’eau : Loire-Bretagne ArchiMer
Soudant, Dominique; Belin, Catherine.
La Directive Cadre sur l’Eau (DCE 2000/60/CE) du 23 octobre 2000 définit un cadre pour la gestion et la protection des eaux par grand bassin hydrographique au plan européen. Elle fixe un objectif de bon état écologique et chimique pour les eaux superficielles. La Directive s’appuie sur l’évaluation d’un certain nombre d’éléments de qualité pour définir l’état global d’une masse d’eau. La liste des éléments de qualité à prendre en compte varie selon la catégorie d’eau superficielle. Le phytoplancton figure parmi les éléments de qualité biologiques retenus pour la classification de l'état écologique des masses d’eaux littorales, c’est à dire les eaux côtières et de transition. Il est évalué à partir de trois composantes : biomasse, abondance et composition...
Tipo: Text
Ano: 2009 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00015/12586/9461.pdf
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Évaluation DCE décembre 2008, Éléments d’expertise - Élément de qualité : phytoplancton, Agence de l’eau : Rhône-Méditerranée-Corse ArchiMer
Soudant, Dominique; Belin, Catherine.
La Directive Cadre sur l’Eau (DCE 2000/60/CE) du 23 octobre 2000 définit un cadre pour la gestion et la protection des eaux par grand bassin hydrographique au plan européen. Elle fixe un objectif de bon état écologique et chimique pour les eaux superficielles. La Directive s’appuie sur l’évaluation d’un certain nombre d’éléments de qualité pour définir l’état global d’une masse d’eau. La liste des éléments de qualité à prendre en compte varie selon la catégorie d’eau superficielle. Le phytoplancton figure parmi les éléments de qualité biologiques retenus pour la classification de l'état écologique des masses d’eaux littorales, c’est à dire les eaux côtières et de transition. Il est évalué à partir de trois composantes : biomasse, abondance et composition...
Tipo: Text
Ano: 2009 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00015/12589/9465.pdf
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Évaluation DCE décembre 2008, Éléments d’expertise - Élément de qualité : phytoplancton, Agence de l’eau : Seine-Normandie ArchiMer
Soudant, Dominique; Belin, Catherine.
La Directive Cadre sur l’Eau (DCE 2000/60/CE) du 23 octobre 2000 définit un cadre pour la gestion et la protection des eaux par grand bassin hydrographique au plan européen. Elle fixe un objectif de bon état écologique et chimique pour les eaux superficielles. La Directive s’appuie sur l’évaluation d’un certain nombre d’éléments de qualité pour définir l’état global d’une masse d’eau. La liste des éléments de qualité à prendre en compte varie selon la catégorie d’eau superficielle. Le phytoplancton figure parmi les éléments de qualité biologiques retenus pour la classification de l'état écologique des masses d’eaux littorales, c’est à dire les eaux côtières et de transition. Il est évalué à partir de trois composantes : biomasse, abondance et composition...
Tipo: Text
Ano: 2009 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00015/12590/9466.pdf
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Evaluation DCE février 2011 - Elément de qualité : salinité - Convention 2010 - Action 7 ArchiMer
Daniel, Anne; Soudant, Dominique.
La salinité figure parmi les éléments de qualité physico-chimiques retenus par la DCE pour la classification de l'état écologique des masses d’eaux littorales. Le présent document est un premier essai d’évaluation réalisée sur les masses d’eaux retenues au titre du contrôle de surveillance, à partir des données disponibles dans Quadrige² sur la période 2004-2009.
Tipo: Text
Ano: 2011 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00037/14779/12089.pdf
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Evaluation DCE février 2011 Elément de qualité : transparence ArchiMer
Daniel, Anne; Soudant, Dominique.
La transparence figure parmi les éléments de qualité physico-chimiques retenus par la DCE pour la classification de l'état écologique des masses d’eaux littorales. Le présent document est un premier essai d’évaluation réalisée sur les masses d’eaux retenues au titre du contrôle de surveillance, à partir des données disponibles dans Quadrige² sur la période 2004-2009.
Tipo: Text
Ano: 2011 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00037/14780/12090.pdf
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Évaluation DCE janvier 2010 - Élément de qualité : phytoplancton ArchiMer
Soudant, Dominique; Belin, Catherine.
Tipo: Text
Ano: 2010 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00030/14148/11400.pdf
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Évaluation DCE janvier 2010 - Éléments d’expertise - Élément de qualité : phytoplancton, Agence de l’eau : Adour-Garonne ArchiMer
Soudant, Dominique; Belin, Catherine.
Tipo: Text
Ano: 2010 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00030/14146/11397.pdf
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